La Direction Scientifique a pour  mission principale de mettre en œuvre de  la politique définie par la direction générale dans les domaines de la Recherche, la Santé Publique et de l’Environnement. Elle est chargée :

•  de la Recherche en santé du CPC, en accord avec les priorités de la stratégie sectorielle du Ministère de la Santé Publique ;
• de l’animation scientifique.  A ce titre elle  anime le Comité Scientifique  et coordonne l’organisation des Journées Scientifiques du CPC ;
• de l’accueil des étudiants : masters, doctorants ;
• du respect des contraintes éthiques ;
• des activités de santé publique (surveillance des maladies infectieuses, contrôle qualité et renforcement des capacités des laboratoires) ;
• de la recherche et l’analyse microbiologique et physicochimique des eaux, des aliments et de  l’environnement.

Elle comprend :

• le Service d’Epidémiologie et Santé Publique ;
• le Service d’Hygiène et Environnement –Microbiologie ;
• le Service d’Hygiène et Environnement Physico-Chimie ;
• le Service de Mycobactériologie ;
• le Service Paludisme ;
• le Service de Virologie.

Les Services de Mycobactériologie et de Virologie sont rattachés hiérarchiquement à la Direction Scientifique et fonctionnellement à la Direction Médicale pour leurs activités de service.

Le soutien financier par des bailleurs est essentiel  pour mener l’ensemble de ces activités.

Le Directeur Scientifique est le Dr Sara Eyangoh.