La Direction Médicale assure la prise en charge des patients qui s'adressent au Centre Pasteur du Cameroun pour des analyses médicales, la vaccination et la prévention de la rage. Elle assure de plus la formation initiale et continue des professionnels de la santé en analyses médicales. Elle comprend 8 services qui sont: 

•  Accueil et prélèvement
• Anatomie et cytologie pathologiques
• Bactériologie
• Biochimie
• Hématologie
• Sérologie
• Centre de vaccinations Internationales et antirabique
• Ecole de formation des techniciens en  analyses médicales

Le laboratoire d'Anayses médicales est ouvert en continu, soit 24 heures sur 24 et 7 jours sur 7. Arrimé à une démarche de management de la qualité, il a obtenu en 2019 une accréditation Iso 15189 pour les laboratoires de virologie e de sérologie. 

L'école de formation des techniciens médico-sanitaires du CentrePasteur du Cameroun propose un cursus est de 3 ans. Elle accueille 2 promotions par année.

Le Directeur Médical est le Dr Suzanne Belinga