Le Laboratoire de Virologie du Centre Pasteur du Cameroun apporte une nouvelle contribution à la connaissance de la diversité génétique des virus circulant au Cameroun avec la publication d’une étude consacrée à l’identification et à la caractérisation moléculaire de 10 nouveaux variants recombinants du virus de l’hépatite C (VHC).

Intitulée « Identification et caractérisation moléculaire de 10 nouveaux variants recombinants du virus de l’hépatite C (VHC) au Cameroun par séquençage Oxford Nanopore et analyse phylogénomique », cette étude met en évidence l’expertise du laboratoire dans les domaines de la génomique virale, du séquençage de nouvelle génération et de la bioinformatique. Une étude menée sur 512 patients atteints d’une infection chronique par le VHC.  Pour mener cette étude, les chercheurs ont analysé les données de 512 patients atteints d’une infection chronique par le VHC. Parmi les échantillons étudiés, 10 (1,9 %) présentaient une discordance de génotype, faisant suspecter la présence de phénomènes de recombinaison génétique.

Afin de caractériser ces profils atypiques, les équipes du Laboratoire de Virologie ont eu recours au séquençage du génome complet du VHC par technologie Oxford Nanopore. Cette approche a été complétée par des analyses phylogénomiques et des analyses spécifiques de recombinaison. Ces investigations ont permis de confirmer la nature recombinante des 10 isolats et d’en caractériser la structure génomique.
Le génome complet pour révéler la complexité du VHC
Les résultats mettent notamment en évidence des recombinants impliquant les génotypes 2/1 et 4/1, ainsi qu’un isolat présentant une structure génomique particulièrement complexe.

Ces observations sont particulièrement importantes dans le contexte de l’étude de la diversité du VHC. La recombinaison génétique étant considérée comme un phénomène relativement rare chez ce virus, la détection de ces variants souligne l’intérêt d’approches permettant d’explorer l’intégralité du génome viral. L’étude montre également les limites que peut présenter une caractérisation reposant uniquement sur l’analyse de fragments du génome. Le séquençage du génome complet permet en effet de révéler des formes de diversité et de complexité virale qui pourraient ne pas être détectées par des approches ciblant des régions génomiques limitées.

Des résultats aux implications multiples pour la santé publique

Au-delà de leur intérêt scientifique, ces résultats contribuent à renforcer les connaissances nécessaires à une meilleure surveillance du VHC. Ils présentent notamment des implications pour :• l’amélioration de la classification et de la surveillance moléculaire des variants du VHC ;
• la compréhension de l’évolution et de la diversité génétique du virus ;
• l’amélioration et l’adaptation des outils diagnostiques face à la diversité des variants circulants ;
• l’orientation des recherches sur de futures stratégies vaccinales. La caractérisation de ces variants contribue ainsi à enrichir les données disponibles sur la diversité génétique du VHC en Afrique et à mieux documenter l’évolution des populations virales.

Le Centre Pasteur du Cameroun, au cœur de la recherche en génomique virale

À travers cette étude, le Centre Pasteur du Cameroun réaffirme son rôle dans la production de connaissances scientifiques utiles à la santé publique au Cameroun et en Afrique.
En mobilisant des technologies de pointe, notamment le séquençage à haut débit, ainsi que des compétences en génomique, phylogénomique et bioinformatique, le Laboratoire de Virologie contribue à mieux comprendre les agents pathogènes, à documenter leur évolution et à produire des données essentielles pour renforcer la surveillance des maladies infectieuses.
Cette nouvelle publication illustre ainsi la volonté du Centre Pasteur du Cameroun de faire de la recherche et de l’innovation des leviers au service de la santé publique, en transformant les données scientifiques en connaissances susceptibles d’éclairer le diagnostic, la surveillance et la réponse aux enjeux sanitaires actuels et futurs.

Consulter l’article complet : JMV – 2026 – Mounchili‐Njifon – Identification and Molecular Characterization of 10 Novel (1)