Le Conseil d’Administration définit, oriente la politique générale du Centre et en évalue la gestion, dans les limites fixées par ses missions et conformément à la réglementation en vigueur. Il adopte les budgets et approuve les rapports annuels de performance.
La Direction Générale est chargée de l’application de la politique générale et de la gestion du Centre. Elle doit rendre compte au CA et aux organismes de tutelle de l’exécution de cette stratégie ainsi que de son budget. Pour ce faire, la Direction Générale s’appuie sur un comité de Direction à Yaoundé et un Directeur délégué à Garoua.
Le Directeur Général s’appuie également sur un comité scientifique qui l’aide à définir les axes stratégiques de développement, notamment dans les domaines de la santé publique et la recherche. Membre de droit de l’assemblée des Directeurs du Pasteur Network (PN), il assure l’ancrage du CPC dans ce réseau.



Sont rattachés à la direction générale les services et activités ci-dessous :